CEMEDE es una unidad estratégica académica integral, disciplinaria o interdisciplinaria, que articula sistemáticamente subprogramas, proyectos y actividades para atender y dar soluciones a la problemática económica, social, ambiental, política y cultural de la región Mesoamericana. Se trabaja en conjunto con otras unidades académicas de la Universidad Nacional, con otras universidades y entes estatales, así como con organizaciones públicas y privadas de carácter nacional e internacional. El CEMEDE ha venido funcionando en la Sede Regional Chorotega a partir del 2005, trabajando en diferentes áreas temáticas del desarrollo sostenible, donde se han ejecutado más de 30 proyectos de investigación y extensión, así como diferentes actividades académicas como  seminarios, simposios, talleres, cursos, conferencias, mesas redondas y congresos.